Claro, solo tienes coste físico, no financiero, aunque este último se actualizará cuando se termine la orden.
Lo que si va a pasar es que tendrás un inventario financiero negativo, por lo tanto si vas al modelo de inventario y no permites el inventario negativo financiero no te dejará venderlo (con una factura, si te dejará entregarlo) hasta que no termines la orden que tiene marcada.
Si prefieres cerrar las ordenes de forma automática puedes crear un batch diario que termine las ordenes de producción finalizadas (estado “report as finished” y “report remainder as finished=0”) De esta forma las cerráis todas las noches aunque si faltan costes por imputar sería un problema posterior.
Saludos.